藏獒作为世界大型犬的原始祖先，在世界犬品种的形成和发展中发挥了重要的作用。藏獒的品种基因库中汇聚了世界犬品种最优良的性状、性能基因，具有在不同生态环境与生存条件中保持高度协调、统一和适应的丰富的遗传多样性。藏獒是在青藏高原独特的自然生态环境和自然条件下培育成功的犬品种，能良好地适应于高海拔、低氧压、强辐射、多降雨等各种自然地理、气候条件，在藏獒身上我们可以清楚地看到自然条件对生活在该特定环境下动物影响的烙印，了解环境与动物有机体产生互作的方式、途径及产生的影响，为人类进一步探索青藏高原的奥秘，探索生存在世界屋脊的动物适应环境的方式与能力，为全面开展对青藏高原生物多样性保护奠定研究基础，其理论与现实意义十分突出。
对藏獒品种资源遗传多样性保护，是人类管理和利用该犬现有资源以获得最大的持续利益，并为了未来的需求保持一定的资源潜力而开展的一项极有意义的工作，也是对藏獒品种资源进行保存、维持、持续利用、恢复和改善的积极措施。为此，可以采取原位保存或易位保存的方法，即在自然生态环境条件下，维持一个活体的藏獒群体，并在该群体内实施各种有效措施，防止由于群体混杂、选择、近交、迁移及疫病等诸多因素可能造成的群体内遗传基因的流失（遗传漂变）。另一种对藏獒品种的保护方法是利用一些现代化的动物生物技术保护藏獒品种资源基因库，比如冷冻保存藏獒犬的胚胎、精液、卵子、体细胞以及DNA文库等。
目前我们在开展对藏獒品种资源保护与选育时，必须注意保持藏獒基本的种质特征或品种性能，必须对藏獒最重要、最基本的性能特征有较深刻地认识。
藏獒是一原始的地方犬种，也是一个高度混杂的犬种。在藏獒品种培育的漫长历史长河中，由于当时游牧居住在青藏高原的诸多少数民族部族间的交流和来往，使得藏獒在品种形成的过程中曾受到蒙古犬、哈萨克犬以及来自印度、尼泊尔等国外品种犬的多方面影响，同时藏獒从未经过人类有目的、有标准的系统选育，未能有人科学确定对藏獒的选育标准、选育要求、方法与原则，直到今天，原有藏獒种群中仍存在大量毛色混杂，性能低下的个体。因此，在开展藏獒品种保护中，必须同时加强对该犬品种的选育。其目的是针对藏獒犬在体形外貌和气质晶位中的不良表现，进行严格选择。要通过选择和培育，打破原藏獒群体遗传结构的平衡，选择优良基因，恰当运用近交、同质选配等手段，迅速提高优良基因的频率。保种的目的在于全面地维持藏獒群体结构的稳定或保护品种基因库的稳定，其与藏獒品种性能的选育是矛盾的。因此，为能同时并举，必须建立藏獒保种群，并严格实行闭锁繁育，遵循动物群体遗传学原理控制选择、基因突变、近交、迁移等因素可能对藏獒品种基因库保护造成的不良影响和可能产生的遗传漂变，实行以保存藏獒遗传性能为目的的系统保种方法。
目前国内对生物资源保护和保存有三种方式，即活体原位保存、精子（卵子）或胚胎的超低温保存、DNA保存，藏獒品种资源保护亦然。这些方法各有利弊，在有条件时应当共同使用，以便互相补充。
对藏獒品种资源实行活体保护的方法是目前最为实际和实用的方法，能对藏獒的保护与利用有机结合，在利用中动态地保护品种资源，将藏獒品种资源的保护、选育、利用结合在一起，保护是基础，选育促进利用又利于加强保护。为此要求应按一定的公母比例、年龄结构和饲养条件组建具有一定规模的藏獒品种保种选育群，利用动物育种技术和手段，加强选育，选优提纯，突出藏獒品种性能，更促进藏獒的利用。但是采用这种活体保护藏獒的方法，一则维持成本很高，同时要有相应的动物育种技术，特别是有关防止基因漂变、基因流失和出现疫病、近交衰退等问题，保证犬群的正常运转。
根据甘